农业面源污染是指在农业生产活动中，氮肥和磷肥等营养物质、农药以及其他有机或无机污染物质，通过农田的地表径流和农田渗漏形成的环境污染，主要包括化肥污染、农药污染、畜禽粪便污染、秸秆燃烧污染等。所以农业面源的监测任务就显得尤为重要。

1.化肥污染

农作物中化肥的利用率并不高，被农作物吸收利用的养分少之又少，剩余的养分通过各种途径，如径流、淋溶、反硝化、吸附和侵蚀等进入环境。这些过量施用的化肥流入水中，使水中藻类迅速生长繁殖，消耗大量的溶解氧，导致水体丧失应有功能进入土地中，会改变原有土壤的结构和特性，造成土壤板结，有机质减少。另外化肥中过量的重金属成分积存在环境中，若被农作物吸收，会损害人体健康。主要监测指标为COD、磷酸盐、pH、悬浮物、氟化物、氨氮

2.农药污染

农业生产中普遍使用的还是有机氯、有机磷种类的农药，据资料显示，喷洒粉剂或液体农药，95%以上的或附着在植物表面，或降落到地面，或飘游于空中。由于农药没有得到合理的使用，大部分被浪费，这部分农药通过各种渠道流入水体，致使水体各种污染物质含量超标，水质恶化。主要监测指标为COD、挥发酚、硫化物、悬浮物。

3.禽畜场污染

从畜禽养殖场产生大量的有机污染物和氮、磷等，随每天冲洗的污水流入河道、湖泊，造成水体污染、对环境造成严重污染。主要监测指标为磷、氮。